W niektórych sytuacjach, w puli serwerowej Citrix XenServer mogą pozostać widoczne repozytoria danych (SR), które nie istnieją lub są niedostępne. W takim przypadku najczęściej z poziomu XenCenter nie ma możliwości ich usunięcia. Aby usunąć zbędne repozytoria trzeba posłużyć się CLI.