Wiersz poleceń w Citrix XenServer posiada bardzo rozbudowaną funkcjonalność i umożliwia wykonanie praktycznie każdej operacji, która może być potrzebna administratorowi systemu. Jedną z takich operacji może być wyświetlenie adresu MAC karty sieciowej wybranej maszyny wirtualnej.
W przypadku wystąpienia awarii serwera pełniącego rolę serwera głównego (pool master) w grupie serwerów XenServer, możemy utracić możliwość centralnego zarządzania. W momencie gdy zawiedzie sprzęt a jego naprawa i przywrócenie może potrwać dłuższą chwile najlepszym rozwiązaniem jest wyznaczenie nowego serwera pool master.
Podczas eksportu maszyny wirtualnej, komputer z XenCenter, wykonujący zadanie, utracił łączność z serwerem XenServer. Mimo prób, wznowienie eksportu nie powiodło się. Z poziomu XenCenter VM była oznaczona nadal jako „w trakcie eksportu”. Nie dało się z nią nic zrobić. Anulowanie zadania powiodło się dopiero po wykonaniu polecenia xe-toolstack-restart.
W grudniu 2017 roku Citrix zaprezentował światu nową wersję XenServer 7.3. Jak to bywało już wielokrotnie w przeszłości producent postanowił trochę namieszać w dostępnych za darmo funkcjach XenServer. Nowa wersja XenServer 7.3 w wersji Free należąca do gałęzi Current Release (CR) została okrojona z kilku bardzo użytecznych funkcji. Funkcjonalność usunuęta z wersji Free znajduje się obecnie w płatnej wersji Standard. Obecna wersja Standard 7.3 jest niemal identyczna z poprzednią wersją Free, wzbogaconą o suport oraz hotfixy od Citrixa.
Zmiany serwera pełniącego rolę pool master w XenServer możemy dokonać za pomocą kilku poleceń z poziomu CLI.
W niektórych sytuacjach, w puli serwerowej Citrix XenServer mogą pozostać widoczne repozytoria danych (SR), które nie istnieją lub są niedostępne. W takim przypadku najczęściej z poziomu XenCenter nie ma możliwości ich usunięcia. Aby usunąć zbędne repozytoria trzeba posłużyć się CLI.