Podczas wykonywania pełnych kopii zapasowych przy pomocy vzdump w ProxmoxVE, dobrym pomysłem jest używane kompresji gzip – pozwala to znacząco zaoszczędzić miejsce potrzebne na przechowywanie archiwów z backupem. Standardowy gzip podczas tworzenia archiwum używa jednego rdzenia CPU – między innymi dlatego nie obciąża on zbytnio serwera. W przypadku gdy dysponujemy wolną mocą obliczeniową, w celu przyspieszenia kompresji tworzonych kopii zapasowych można użyć programu pigz.
Dodanie konsoli szeregowej do linuksowych maszyn wirtualnych w Proxmox VE, rozszerza możliwości zarządzania systemami operacyjnymi uruchomionych VM. Po dodaniu portu szeregowego do VM w przypadku braku sieci w VM (brak możliwość zarządzania VM przez SSH), problemami z dostępem przez VNC zarządzanie wciąż będzie możliwe poprzez wydanie prostego polecenia qm terminal
Synchronizacja czasu (NTP) jest bardzo ważnym elementem, który ma wpływ na poprawne działanie wielu systemów. Podobnie jest w Proxmox VE, w szczególności w instalacjach wieloserwerowych (klastrach) oraz podczas używania systemu plików Ceph, który w przypadku braku synchronizacji czasu między serwerami może po prostu przestać działać.
QEMU Guest Agent to dodatkowe oprogramowanie instalowane na maszynach wirtualnych. Jego głównym zadaniem jest wymiana informacji pomiędzy serwerem wirtualizacyjnym a systemem operacyjnym maszyny wirtualnej oraz wykonywanie dodatkowych poleceń w systemie gościa. W Proxmox VE oprogramowanie QEMU Guest Agent wykorzystywane jest np. do przeprowadzenia poprawnej procedury zamknięcia systemu gościa – zamiast polegania na poleceniach ACPI lub ustawieniach systemów. QEMU GA wykorzystywane jest także do zablokowania system plików gościa podczas tworzenia kopii zapasowej.
W celu zainstalowania systemu operacyjnego na maszynie wirtualnej w Proxmox VE wymagany jest nośnik instalacyjny systemu gościa. W Proxmox VE istnieje możliwość wykorzystania fizycznego napędu podłączonego do serwera lub obrazów ISO, co jest zdecydowanie wygodniejszym rozwiązaniem. W przypadku stosowania pojedynczego serwera wirtualizacji (a nie klastrów – tutaj lepiej zrobić oddzielne repozytorium udostępnianie przez np. NFS) obraz ISO można wgrać do lokalnego systemu plików wybranego serwera.
Proxmox VE umożliwia łączenie pojedynczych serwerów w grupy tzw. klaster serwerowy. Budowa klastra w Proxmox VE nie jest skomplikowaną czynnością. Wszystkie operacji można dokonać z poziomu konsoli serwera za pomocą dedykowanego narzędzia pvecm (Proxmox VE Cluster Manager).